Основной задачей отдела ветеринарно-санитарной экспертизы является обеспечение выполнения требований законодательства в области ветеринарии.
Свою деятельность отдел ВСЭ осуществляет во взаимодействии с участковыми ветеринарными лечебницами, лабораториями ветеринарно- санитарной экспертизы рынков, а также с руководителями организаций и предприятий, связанных с животноводством, переработкой и реализацией продуктов своей работе руководствуются:
Приказ Министерства сельского хозяйства РФ от 27 декабря 2016 г. № 589 “Об утверждении Ветеринарных правил организации работы по оформлению ветеринарных сопроводительных документов, порядка оформления ветеринарных сопроводительных документов в электронной форме и порядка оформления ветеринарных сопроводительных документов на бумажных носителях”